Согласно новому исследованию, в Мировом океане обнаружено более 5000 новых типов вирусов.
Ученые проанализировали десятки тысяч проб воды со всего мира в поисках РНК-вирусов или вирусов, использующих РНК как наследственный материал. Новый коронавирус, например, представляет собой тип РНК-вируса. Эти вирусы изучаются в сравнении с ДНК-содержащими вирусами. ДНК Как генетический материал, говорят авторы.
Разнообразие недавно открытых вирусов было настолько велико, что исследователи предложили удвоить количество таксономических групп, необходимых для классификации РНК-вирусов, с нынешних пяти до 10 типов. (Эра — это широкая классификация в биологии, подпадающая под понятие «царство».)
«Здесь много нового разнообразия — и полное разнообразие [new] Тип Taraviricota встречается во всех океанах, что указывает на его экологическую важность», — сказал ведущий автор исследования Мэтью Салливан, профессор микробиологии в Университете штата Огайо. Он сказал в заявлении (Откроется в новой вкладке).
Связанный: Самый смертоносный вирус в истории
По словам Салливана, исследования РНК-вирусов обычно сосредоточены на тех, которые вызывают заболевания. (Некоторые хорошо известные РНК-вирусы включают грипп, лихорадку Эбола и коронавирус, вызывающий COVID-19.) Но это лишь «небольшая часть» РНК-вирусов на Земле, сказал Салливан.
«Мы хотели систематически изучить его в очень большом масштабе и изучить среду, которую никто не изучал глубоко», — сказал Салливан в заявлении.
Для исследования, опубликованного в четверг (7 апреля) в журнале Наука (Откроется в новой вкладке)В ходе исследования исследователи проанализировали 35 000 проб воды, взятых в 121 месте во всех пяти мировых океанах. Исследователи являются частью консорциума Tara Ocean Consortium, глобального проекта по изучению воздействия Изменение климата на океане.
Исследователи заявили, что изучили генетические последовательности, извлеченные из мелких водных организмов, известных как планктон, которые являются обычными хозяевами для РНК-вирусов. Они остановились на последовательностях, принадлежащих РНК-вирусам, путем поиска древнего гена, называемого RdRp, который обнаружен во всех РНК-вирусах, но отсутствует в других вирусах и клетках. Они идентифицировали более 44 000 последовательностей с этим геном.
Но гену RdRp миллиарды лет, и он много раз эволюционировал. Поскольку эволюция гена уходит далеко в прошлое, исследователям было трудно определить эволюционную взаимосвязь между последовательностями. Поэтому исследователи использовали машинное обучение, чтобы организовать их.
В целом они выявили около 5500 новых видов РНК-вирусов, которые попали в пять существующих классов, а также пять новых предложенных классов, которые исследователи назвали Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota и Arctiviricota.
Вирусы типа Taraviricota были особенно многочисленны в умеренных и тропических водах, в то время как вирусы типа Arctiviricota широко распространены в Северном Ледовитом океане, пишут исследователи в своей работе. Беседа. (Откроется в новой вкладке)
Понимание того, как ген RdRp меняется с течением времени, может привести к лучшему пониманию того, как развивается ранняя жизнь. ЗемляСказали авторы.
«Предполагается, что RdRp является одним из старейших генов — он присутствовал до того, как понадобилась ДНК», — говорится в заявлении соавтора исследования Ахмеда Зайеда, ученого-исследователя в области микробиологии штата Огайо. Так мы проследим не только происхождение вирусов, но и происхождение жизни.
Первоначально опубликовано на Live Science.
«Наркоман поп-культуры. Поклонник телевидения. Ниндзя алкоголика. Абсолютный фанат пива. Профессиональный знаток твиттера».
More Stories
Ядро Плутона, вероятно, образовалось в результате древнего столкновения
НАСА может модифицировать Artemis III, чтобы иметь возможность стыковать Starship и Orion на низкой околоземной орбите.
Замечательные результаты. Новое исследование показывает, что спинной мозг способен учиться и запоминать.