В пищеварительной системе человека обнаружен совершенно новый класс жизни: ScienceAlert

Изучая лес микробов, живущих внутри нас, исследователи наткнулись на совершенно новый класс вирусоподобных организмов.

«Это безумие», — говорит Марк Пайфер, клеточный биолог из Университета Северной Каролины, не принимавший участия в исследовании. Рассказывать Элизабет Пенниси Научный журнал. «Чем больше мы смотрим, тем более безумные вещи мы видим».

Эти загадочные кусочки генетического материала не имеют обнаруживаемых последовательностей или даже известных структурных сходств с другими биологическими агентами.

Биолог из Стэнфордского университета Иван Жилодев и его коллеги говорят, что их странное открытие может быть вовсе не вирусами, а, скорее, совершенно новым набором объектов, которые могут помочь преодолеть древний разрыв между простейшими генетическими молекулами и более сложными вирусами.

«Опелаксы включают в себя класс разнообразных РНК, которые колонизировали человеческие и глобальные микробы и не наблюдались». Пишем на бумаге для препринтов.

Генетическая последовательность обелисков, названная в честь высокосимметричных палочковидных структур, образованных скрученными отрезками рибонуклеиновой кислоты (РНК), имеет размер всего около 1000 букв (нуклеотидов). Фактически, эта краткость, вероятно, является одной из причин, по которой мы не заметили их раньше.

В исследовании, которое еще не прошло рецензирование, Жилодев и его команда просмотрели 5,4 миллиона наборов данных опубликованных генетических последовательностей и идентифицировали почти 30 000 различных последовательностей. Он появился примерно у 10% человеческих микробов, которые исследовала команда.

В одном наборе данных обелиски присутствовали в 50% образцов ротовой полости пациентов. Более того, разные типы обелисков, похоже, расположены в разных частях нашего тела.

«[This] «Поддерживает идею о том, что обелиски могут содержать колонизаторов вышеупомянутых человеческих микробов». Он объясняет.

Им удалось выделить из нашего микробиома один тип клеток-хозяев, а именно бактерии. Стрептококк кровавыйс — Распространенный ротовой микроб человека. Обелиск у этих микробов содержит петлю длиной 1137 нуклеотидов.

«Хотя мы не знаем «хозяев» других обелисков», Он написал Жилодев и коллеги. «Разумно предположить, что по крайней мере какая-то часть находится в бактериях».

Независимо от источника обелисков, все они, по всей видимости, содержат символы нового класса белков, которые исследователи назвали облинами.

Инструкции по созданию этих белков, похоже, занимают как минимум половину генетического материала Обелисков. Поскольку эти белки очень похожи во всех обелисках, исследователи подозревают, что они могут участвовать в процессе репликации объекта.

Эта способность кодировать белки отличает их от других известных петель РНК, называемых вироидами, но у них также, по-видимому, нет генов, необходимых для создания белковых оболочек, в которых живут РНК-вирусы (включая Covid-19), находясь вне клеток. .

Они также намного крупнее других генетических молекул, сосуществующих внутри клеток, от растений до бактерий, которые называются… Плазмидыкоторый обычно состоит из ДНК.

Однако Жилодев и его команда не смогли выявить какое-либо влияние обелисков на их бактериальных хозяев или способы, с помощью которых они могли распространяться между клетками.

«Эти элементы могут не иметь вирусной природы и могут больше напоминать РНК-плазмиды». Мы заключаем.

Это исследование было отправлено в службу предварительной печати. com.bioRxiv.